Parallel met de longitudinale veldstudie zullen meststalen van biggen met diarree in de kraamstal en de batterij gecollecteerd worden. Hierin zullen de verschillende rotavirus species die voorkomen bij varkens, namelijk A, B, C en H, gediagnosticeerd worden en positieve isolaten zullen verder gekarakteriseerd worden. Voor RVA en RVC zullen reeds beschikbare RT-qPCR testen gebruikt worden en indien nodig nog verbeterd worden. Testen voor RVB en RVH zullen ontwikkeld worden tijdens dit project. Met de resultaten van dit werkpakket en deze van de longitudinale veldstudie (WP-1) zullen we associaties maken tussen types rotavirussen en de geobserveerde symptomen. Zo zullen types geïdentificeerd worden die geassocieerd zijn met diarree. Tegen deze pathotypes zullen specifieke testen ontwikkeld worden, zodat ze eenvoudig en snel kunnen gediagnosticeerd worden.