Het rotavirus wordt na passage door de M-cel doorgegeven aan de antigen-presenterende cel en de B-lymfocyt, die het virus zullen verwerken. Op deze manier zal de antigen-presenterende cel stukjes virus op zijn oppervlak presenteren die vervolgens herkend worden door T-lymfocyten (Figuur 2A). Deze zullen hierop als een reactie cytokines vrijstellen (Figuur 2A) die de B-lymfocyt doen differentiëren in een plasmacel (Figuur 2B). Deze plasmacellen zullen snel beginnen delen en migreren naar de lamina propria van de darmvilli. Hier produceren ze grote hoeveelheden IgA antistoffen die via transcytose doorheen de enterocyt in het darmlumen terechtkomen (Figuur 2C). Tijdens dit proces verkrijgen ze een secretorische component (SIgA) die de antistoffen beschermt tegen de proteolytische omgeving van in het darmlumen. De SIgA antistoffen neutralizeren viruspartikels in het darmlumen en zorgen ervoor dat ze de doelwitcellen niet meer kunnen infecteren. Op deze manier is het varken beschermd tegen herinfecties met het rotavirus.

Zoals eerder vermeld zullen de lactogene SIgA antistoffen de jonge biggen beschermen tegenover een infectie met het rotavirus. Bij zeugen met een goed ontwikkelde lactogene immuniteit is dit het geval (Figuur 4). Bij het spenen valt de melk van de zeug abrupt weg en als gevolg hiervan verdwijnen ook de SIgA antistoffen die ze hiermede opnamen (Figuur 4). Wanneer een infectie met het rotavirus op dit moment optreedt, zal deze niet meer geneutraliseerd kunnen worden door de SIgA antistoffen uit de melk en zal deze dus kunnen aanslaan. Dit kan leiden tot de ontwikkeling van diarree.